Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DOBP13765 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DOBP13765 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DOBP13765 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DOBP13765 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DOBP13765 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DOBP13765 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DOBP13765 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DOBP13765 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DOBP13765 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DOBP13765 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DOBP13765 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DOBP13765 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DOBP13765 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DOBP13765 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DOBP13765 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DOBP13765 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DOBP13765 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DOBP13765 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DOBP13765 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DOBP13765 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOBP13765 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOBP13765 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOBP13765 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOBP13765 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOBP13765 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DOBP13765 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DOBP13765 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DOBP13765 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DOBP13765 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DOBP13765 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DOBP13765 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DOBP13765 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HLA-DOBP13765 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DOBP13765 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DOBP13765 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DOBP13765 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DOBP13765 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DOBP13765 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DOBP13765 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DOBP13765 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DOBP13765 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DOBP13765 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DOBP13765 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DOBP13765 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DOBP13765 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DOBP13765 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DOBP13765 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DOBP13765 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DOBP13765 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-DOBP13765 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-DOBP13765 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-DOBP13765 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-DOBP13765 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-DOBP13765 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-DOBP13765 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-DOBP13765 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-DOBP13765 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-DOBP13765 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-DOBP13765 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-DOBP13765 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-DOBP13765 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-DOBP13765 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-DOBP13765 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-DOBP13765 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-DOBP13765 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-DOBP13765 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DOBP13765 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DOBP13765 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DOBP13765 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DOBP13765 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DOBP13765 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DOBP13765 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DOBP13765 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DOBP13765 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DOBP13765 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DOBP13765 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DOBP13765 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DOBP13765 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DOBP13765 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DOBP13765 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DOBP13765 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DOBP13765 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-DOBP13765 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-DOBP13765 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HLA-DOBP13765 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HLA-DOBP13765 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DOBP13765 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DOBP13765 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DOBP13765 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DOBP13765 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DOBP13765 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DOBP13765 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DOBP13765 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DOBP13765 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DOBP13765 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DOBP13765 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DOBP13765 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DOBP13765 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DOBP13765 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.3 ms