Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MTHFD1P11586 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTHFD1P11586 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTHFD1P11586 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTHFD1P11586 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTHFD1P11586 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MTHFD1P11586 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTHFD1P11586 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTHFD1P11586 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTHFD1P11586 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTHFD1P11586 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTHFD1P11586 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTHFD1P11586 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTHFD1P11586 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTHFD1P11586 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTHFD1P11586 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MTHFD1P11586 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTHFD1P11586 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MTHFD1P11586 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTHFD1P11586 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTHFD1P11586 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTHFD1P11586 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTHFD1P11586 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTHFD1P11586 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTHFD1P11586 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTHFD1P11586 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MTHFD1P11586 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTHFD1P11586 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MTHFD1P11586 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MTHFD1P11586 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MTHFD1P11586 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MTHFD1P11586 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTHFD1P11586 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTHFD1P11586 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTHFD1P11586 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MTHFD1P11586 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTHFD1P11586 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTHFD1P11586 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTHFD1P11586 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTHFD1P11586 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTHFD1P11586 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTHFD1P11586 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTHFD1P11586 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTHFD1P11586 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTHFD1P11586 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTHFD1P11586 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTHFD1P11586 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTHFD1P11586 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTHFD1P11586 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTHFD1P11586 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTHFD1P11586 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTHFD1P11586 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTHFD1P11586 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTHFD1P11586 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTHFD1P11586 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTHFD1P11586 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTHFD1P11586 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTHFD1P11586 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTHFD1P11586 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTHFD1P11586 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTHFD1P11586 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTHFD1P11586 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTHFD1P11586 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
MTHFD1P11586 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTHFD1P11586 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTHFD1P11586 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTHFD1P11586 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTHFD1P11586 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTHFD1P11586 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTHFD1P11586 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MTHFD1P11586 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTHFD1P11586 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTHFD1P11586 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTHFD1P11586 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MTHFD1P11586 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTHFD1P11586 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTHFD1P11586 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTHFD1P11586 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTHFD1P11586 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTHFD1P11586 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTHFD1P11586 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTHFD1P11586 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTHFD1P11586 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTHFD1P11586 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTHFD1P11586 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTHFD1P11586 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTHFD1P11586 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTHFD1P11586 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTHFD1P11586 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTHFD1P11586 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTHFD1P11586 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MTHFD1P11586 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTHFD1P11586 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTHFD1P11586 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTHFD1P11586 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTHFD1P11586 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTHFD1P11586 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTHFD1P11586 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms