Protein–RNA interactions for Protein: P05976

MYL1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL1P05976 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYL1P05976 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MYL1P05976 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYL1P05976 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYL1P05976 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYL1P05976 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYL1P05976 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MYL1P05976 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYL1P05976 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYL1P05976 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYL1P05976 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYL1P05976 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYL1P05976 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYL1P05976 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYL1P05976 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYL1P05976 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYL1P05976 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYL1P05976 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYL1P05976 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYL1P05976 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYL1P05976 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYL1P05976 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MYL1P05976 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYL1P05976 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYL1P05976 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYL1P05976 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYL1P05976 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYL1P05976 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYL1P05976 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYL1P05976 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYL1P05976 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYL1P05976 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYL1P05976 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYL1P05976 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYL1P05976 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYL1P05976 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYL1P05976 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYL1P05976 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYL1P05976 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MYL1P05976 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYL1P05976 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYL1P05976 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYL1P05976 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYL1P05976 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYL1P05976 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYL1P05976 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MYL1P05976 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYL1P05976 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYL1P05976 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYL1P05976 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYL1P05976 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYL1P05976 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYL1P05976 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYL1P05976 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYL1P05976 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYL1P05976 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYL1P05976 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MYL1P05976 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYL1P05976 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYL1P05976 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYL1P05976 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYL1P05976 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYL1P05976 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYL1P05976 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYL1P05976 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYL1P05976 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MYL1P05976 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYL1P05976 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYL1P05976 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYL1P05976 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYL1P05976 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYL1P05976 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYL1P05976 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYL1P05976 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYL1P05976 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYL1P05976 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYL1P05976 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYL1P05976 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYL1P05976 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYL1P05976 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYL1P05976 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYL1P05976 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYL1P05976 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYL1P05976 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYL1P05976 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYL1P05976 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYL1P05976 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYL1P05976 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYL1P05976 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYL1P05976 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MYL1P05976 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYL1P05976 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYL1P05976 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYL1P05976 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYL1P05976 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYL1P05976 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYL1P05976 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYL1P05976 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYL1P05976 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYL1P05976 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms