Protein–RNA interactions for Protein: P02766

TTR, Transthyretin, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTRP02766 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTRP02766 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTRP02766 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTRP02766 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTRP02766 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TTRP02766 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTRP02766 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTRP02766 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTRP02766 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTRP02766 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTRP02766 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTRP02766 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTRP02766 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTRP02766 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTRP02766 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTRP02766 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTRP02766 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TTRP02766 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTRP02766 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTRP02766 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTRP02766 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTRP02766 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTRP02766 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTRP02766 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TTRP02766 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTRP02766 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTRP02766 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTRP02766 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTRP02766 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTRP02766 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTRP02766 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTRP02766 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTRP02766 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTRP02766 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TTRP02766 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTRP02766 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTRP02766 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTRP02766 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTRP02766 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTRP02766 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTRP02766 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TTRP02766 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTRP02766 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TTRP02766 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TTRP02766 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTRP02766 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTRP02766 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TTRP02766 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTRP02766 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTRP02766 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTRP02766 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTRP02766 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTRP02766 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTRP02766 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTRP02766 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTRP02766 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTRP02766 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTRP02766 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTRP02766 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTRP02766 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTRP02766 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTRP02766 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTRP02766 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTRP02766 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTRP02766 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTRP02766 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTRP02766 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTRP02766 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTRP02766 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTRP02766 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTRP02766 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTRP02766 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTRP02766 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTRP02766 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTRP02766 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTRP02766 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TTRP02766 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTRP02766 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTRP02766 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTRP02766 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTRP02766 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTRP02766 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTRP02766 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTRP02766 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTRP02766 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTRP02766 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTRP02766 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTRP02766 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTRP02766 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTRP02766 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTRP02766 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTRP02766 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTRP02766 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTRP02766 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTRP02766 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTRP02766 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTRP02766 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTRP02766 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTRP02766 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTRP02766 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms