Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
APOC3P02656 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOC3P02656 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOC3P02656 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOC3P02656 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOC3P02656 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOC3P02656 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOC3P02656 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOC3P02656 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOC3P02656 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOC3P02656 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOC3P02656 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOC3P02656 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOC3P02656 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOC3P02656 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOC3P02656 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOC3P02656 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOC3P02656 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC3P02656 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC3P02656 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC3P02656 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC3P02656 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC3P02656 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC3P02656 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC3P02656 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC3P02656 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC3P02656 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC3P02656 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC3P02656 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC3P02656 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC3P02656 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOC3P02656 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOC3P02656 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOC3P02656 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOC3P02656 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC3P02656 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC3P02656 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC3P02656 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC3P02656 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC3P02656 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC3P02656 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOC3P02656 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOC3P02656 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOC3P02656 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOC3P02656 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOC3P02656 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC3P02656 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC3P02656 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC3P02656 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC3P02656 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC3P02656 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC3P02656 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC3P02656 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC3P02656 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC3P02656 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC3P02656 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC3P02656 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC3P02656 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC3P02656 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC3P02656 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC3P02656 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC3P02656 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC3P02656 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC3P02656 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC3P02656 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC3P02656 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC3P02656 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC3P02656 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC3P02656 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC3P02656 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC3P02656 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC3P02656 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC3P02656 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC3P02656 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC3P02656 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC3P02656 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC3P02656 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC3P02656 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC3P02656 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC3P02656 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC3P02656 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC3P02656 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC3P02656 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC3P02656 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOC3P02656 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOC3P02656 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOC3P02656 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC3P02656 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC3P02656 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC3P02656 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC3P02656 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC3P02656 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC3P02656 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC3P02656 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC3P02656 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC3P02656 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC3P02656 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOC3P02656 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC3P02656 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC3P02656 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.3 ms