Protein–RNA interactions for Protein: P01137

TGFB1, Transforming growth factor beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB1P01137 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGFB1P01137 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGFB1P01137 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGFB1P01137 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGFB1P01137 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGFB1P01137 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGFB1P01137 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGFB1P01137 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGFB1P01137 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGFB1P01137 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGFB1P01137 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGFB1P01137 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGFB1P01137 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGFB1P01137 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGFB1P01137 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGFB1P01137 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGFB1P01137 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGFB1P01137 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TGFB1P01137 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TGFB1P01137 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TGFB1P01137 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TGFB1P01137 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TGFB1P01137 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGFB1P01137 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGFB1P01137 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGFB1P01137 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGFB1P01137 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGFB1P01137 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGFB1P01137 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGFB1P01137 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGFB1P01137 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGFB1P01137 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGFB1P01137 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGFB1P01137 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGFB1P01137 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGFB1P01137 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGFB1P01137 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGFB1P01137 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGFB1P01137 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGFB1P01137 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGFB1P01137 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TGFB1P01137 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TGFB1P01137 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TGFB1P01137 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGFB1P01137 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGFB1P01137 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGFB1P01137 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGFB1P01137 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGFB1P01137 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGFB1P01137 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGFB1P01137 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TGFB1P01137 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGFB1P01137 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGFB1P01137 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGFB1P01137 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGFB1P01137 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGFB1P01137 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TGFB1P01137 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGFB1P01137 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGFB1P01137 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGFB1P01137 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGFB1P01137 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGFB1P01137 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TGFB1P01137 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGFB1P01137 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGFB1P01137 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TGFB1P01137 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGFB1P01137 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGFB1P01137 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGFB1P01137 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGFB1P01137 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TGFB1P01137 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TGFB1P01137 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TGFB1P01137 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TGFB1P01137 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGFB1P01137 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGFB1P01137 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGFB1P01137 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGFB1P01137 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TGFB1P01137 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TGFB1P01137 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TGFB1P01137 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TGFB1P01137 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TGFB1P01137 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TGFB1P01137 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TGFB1P01137 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TGFB1P01137 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TGFB1P01137 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TGFB1P01137 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TGFB1P01137 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TGFB1P01137 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TGFB1P01137 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TGFB1P01137 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGFB1P01137 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGFB1P01137 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGFB1P01137 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TGFB1P01137 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGFB1P01137 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGFB1P01137 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGFB1P01137 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms