Protein–RNA interactions for Protein: O75437

ZNF254, Zinc finger protein 254, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF254O75437 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF254O75437 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF254O75437 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF254O75437 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF254O75437 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF254O75437 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF254O75437 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF254O75437 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF254O75437 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF254O75437 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF254O75437 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF254O75437 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF254O75437 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF254O75437 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF254O75437 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF254O75437 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF254O75437 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF254O75437 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF254O75437 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF254O75437 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF254O75437 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF254O75437 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF254O75437 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF254O75437 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF254O75437 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF254O75437 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF254O75437 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF254O75437 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF254O75437 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF254O75437 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF254O75437 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF254O75437 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF254O75437 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF254O75437 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms