Protein–RNA interactions for Protein: O75436

VPS26A, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS26AO75436 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS26AO75436 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS26AO75436 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS26AO75436 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
VPS26AO75436 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VPS26AO75436 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VPS26AO75436 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VPS26AO75436 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS26AO75436 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS26AO75436 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS26AO75436 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS26AO75436 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS26AO75436 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS26AO75436 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS26AO75436 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS26AO75436 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS26AO75436 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS26AO75436 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS26AO75436 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS26AO75436 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS26AO75436 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS26AO75436 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS26AO75436 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS26AO75436 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS26AO75436 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS26AO75436 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
VPS26AO75436 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VPS26AO75436 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VPS26AO75436 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS26AO75436 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS26AO75436 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS26AO75436 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS26AO75436 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS26AO75436 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS26AO75436 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS26AO75436 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS26AO75436 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS26AO75436 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS26AO75436 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS26AO75436 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS26AO75436 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS26AO75436 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS26AO75436 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS26AO75436 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS26AO75436 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS26AO75436 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS26AO75436 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS26AO75436 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS26AO75436 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS26AO75436 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS26AO75436 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS26AO75436 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS26AO75436 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS26AO75436 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS26AO75436 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS26AO75436 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS26AO75436 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS26AO75436 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
VPS26AO75436 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VPS26AO75436 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS26AO75436 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS26AO75436 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS26AO75436 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS26AO75436 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS26AO75436 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS26AO75436 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS26AO75436 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS26AO75436 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS26AO75436 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS26AO75436 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS26AO75436 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS26AO75436 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS26AO75436 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS26AO75436 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS26AO75436 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS26AO75436 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS26AO75436 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS26AO75436 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS26AO75436 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS26AO75436 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
VPS26AO75436 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS26AO75436 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS26AO75436 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS26AO75436 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS26AO75436 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS26AO75436 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS26AO75436 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS26AO75436 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS26AO75436 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS26AO75436 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS26AO75436 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS26AO75436 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS26AO75436 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS26AO75436 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS26AO75436 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS26AO75436 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS26AO75436 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS26AO75436 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS26AO75436 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS26AO75436 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms