Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PPFIA3O75145 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PPFIA3O75145 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PPFIA3O75145 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPFIA3O75145 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPFIA3O75145 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPFIA3O75145 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPFIA3O75145 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPFIA3O75145 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPFIA3O75145 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPFIA3O75145 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPFIA3O75145 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPFIA3O75145 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PPFIA3O75145 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PPFIA3O75145 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPFIA3O75145 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPFIA3O75145 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPFIA3O75145 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PPFIA3O75145 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PPFIA3O75145 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPFIA3O75145 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PPFIA3O75145 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPFIA3O75145 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPFIA3O75145 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPFIA3O75145 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPFIA3O75145 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPFIA3O75145 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPFIA3O75145 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPFIA3O75145 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPFIA3O75145 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPFIA3O75145 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPFIA3O75145 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPFIA3O75145 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPFIA3O75145 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPFIA3O75145 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPFIA3O75145 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPFIA3O75145 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PPFIA3O75145 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PPFIA3O75145 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PPFIA3O75145 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PPFIA3O75145 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PPFIA3O75145 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PPFIA3O75145 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPFIA3O75145 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPFIA3O75145 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPFIA3O75145 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPFIA3O75145 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPFIA3O75145 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPFIA3O75145 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPFIA3O75145 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPFIA3O75145 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPFIA3O75145 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PPFIA3O75145 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PPFIA3O75145 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PPFIA3O75145 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPFIA3O75145 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPFIA3O75145 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPFIA3O75145 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPFIA3O75145 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPFIA3O75145 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
PPFIA3O75145 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PPFIA3O75145 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPFIA3O75145 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPFIA3O75145 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPFIA3O75145 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPFIA3O75145 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPFIA3O75145 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPFIA3O75145 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPFIA3O75145 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PPFIA3O75145 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPFIA3O75145 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPFIA3O75145 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPFIA3O75145 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPFIA3O75145 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PPFIA3O75145 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPFIA3O75145 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPFIA3O75145 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPFIA3O75145 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPFIA3O75145 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PPFIA3O75145 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PPFIA3O75145 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PPFIA3O75145 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPFIA3O75145 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PPFIA3O75145 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PPFIA3O75145 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PPFIA3O75145 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPFIA3O75145 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPFIA3O75145 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPFIA3O75145 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPFIA3O75145 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PPFIA3O75145 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPFIA3O75145 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPFIA3O75145 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPFIA3O75145 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPFIA3O75145 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPFIA3O75145 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPFIA3O75145 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPFIA3O75145 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPFIA3O75145 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPFIA3O75145 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms