Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SELENOFO60613 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SELENOFO60613 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SELENOFO60613 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SELENOFO60613 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SELENOFO60613 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOFO60613 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOFO60613 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOFO60613 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOFO60613 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOFO60613 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOFO60613 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOFO60613 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOFO60613 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOFO60613 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOFO60613 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOFO60613 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENOFO60613 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENOFO60613 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENOFO60613 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENOFO60613 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENOFO60613 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENOFO60613 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENOFO60613 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENOFO60613 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENOFO60613 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SELENOFO60613 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SELENOFO60613 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SELENOFO60613 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SELENOFO60613 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENOFO60613 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENOFO60613 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENOFO60613 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENOFO60613 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENOFO60613 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENOFO60613 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SELENOFO60613 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SELENOFO60613 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SELENOFO60613 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SELENOFO60613 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SELENOFO60613 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SELENOFO60613 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SELENOFO60613 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SELENOFO60613 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SELENOFO60613 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SELENOFO60613 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SELENOFO60613 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SELENOFO60613 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SELENOFO60613 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SELENOFO60613 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SELENOFO60613 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SELENOFO60613 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SELENOFO60613 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SELENOFO60613 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SELENOFO60613 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SELENOFO60613 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SELENOFO60613 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SELENOFO60613 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SELENOFO60613 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SELENOFO60613 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SELENOFO60613 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SELENOFO60613 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SELENOFO60613 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SELENOFO60613 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SELENOFO60613 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SELENOFO60613 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms