Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PPLO60437 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PPLO60437 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
PPLO60437 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PPLO60437 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PPLO60437 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PPLO60437 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PPLO60437 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PPLO60437 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PPLO60437 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PPLO60437 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PPLO60437 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PPLO60437 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PPLO60437 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PPLO60437 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PPLO60437 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PPLO60437 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PPLO60437 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PPLO60437 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PPLO60437 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PPLO60437 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PPLO60437 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PPLO60437 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.46
PPLO60437 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PPLO60437 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PPLO60437 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PPLO60437 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PPLO60437 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
PPLO60437 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
PPLO60437 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
PPLO60437 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PPLO60437 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PPLO60437 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PPLO60437 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PPLO60437 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PPLO60437 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PPLO60437 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PPLO60437 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PPLO60437 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PPLO60437 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PPLO60437 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PPLO60437 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PPLO60437 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
PPLO60437 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PPLO60437 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PPLO60437 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PPLO60437 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PPLO60437 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PPLO60437 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PPLO60437 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PPLO60437 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
PPLO60437 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PPLO60437 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PPLO60437 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PPLO60437 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PPLO60437 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PPLO60437 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PPLO60437 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PPLO60437 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PPLO60437 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PPLO60437 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PPLO60437 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PPLO60437 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PPLO60437 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PPLO60437 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PPLO60437 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PPLO60437 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
PPLO60437 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PPLO60437 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PPLO60437 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PPLO60437 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PPLO60437 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PPLO60437 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
PPLO60437 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
PPLO60437 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PPLO60437 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
PPLO60437 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PPLO60437 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PPLO60437 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PPLO60437 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PPLO60437 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PPLO60437 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PPLO60437 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PPLO60437 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PPLO60437 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PPLO60437 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PPLO60437 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PPLO60437 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PPLO60437 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PPLO60437 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PPLO60437 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PPLO60437 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
PPLO60437 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PPLO60437 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PPLO60437 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PPLO60437 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PPLO60437 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PPLO60437 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PPLO60437 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PPLO60437 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms