Protein–RNA interactions for Protein: O43790

KRT86, Keratin, type II cuticular Hb6, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT86O43790 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT86O43790 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT86O43790 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT86O43790 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT86O43790 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT86O43790 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT86O43790 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT86O43790 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT86O43790 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT86O43790 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT86O43790 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT86O43790 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT86O43790 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT86O43790 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT86O43790 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
KRT86O43790 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT86O43790 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT86O43790 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT86O43790 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT86O43790 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT86O43790 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT86O43790 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT86O43790 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT86O43790 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT86O43790 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT86O43790 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT86O43790 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT86O43790 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT86O43790 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT86O43790 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT86O43790 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT86O43790 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT86O43790 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT86O43790 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT86O43790 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT86O43790 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT86O43790 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT86O43790 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT86O43790 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT86O43790 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT86O43790 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT86O43790 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT86O43790 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT86O43790 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
KRT86O43790 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
KRT86O43790 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT86O43790 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT86O43790 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT86O43790 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT86O43790 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT86O43790 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT86O43790 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT86O43790 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT86O43790 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT86O43790 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT86O43790 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT86O43790 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT86O43790 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT86O43790 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT86O43790 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT86O43790 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT86O43790 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT86O43790 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT86O43790 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT86O43790 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT86O43790 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KRT86O43790 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KRT86O43790 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT86O43790 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT86O43790 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT86O43790 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT86O43790 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT86O43790 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT86O43790 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT86O43790 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT86O43790 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT86O43790 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT86O43790 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT86O43790 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT86O43790 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT86O43790 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT86O43790 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT86O43790 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT86O43790 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT86O43790 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT86O43790 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT86O43790 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT86O43790 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT86O43790 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT86O43790 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT86O43790 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT86O43790 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT86O43790 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT86O43790 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT86O43790 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT86O43790 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT86O43790 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT86O43790 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT86O43790 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT86O43790 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms