Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCEO43556 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCEO43556 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCEO43556 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCEO43556 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCEO43556 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCEO43556 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCEO43556 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCEO43556 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCEO43556 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCEO43556 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCEO43556 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCEO43556 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCEO43556 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCEO43556 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCEO43556 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCEO43556 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCEO43556 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCEO43556 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCEO43556 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCEO43556 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCEO43556 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCEO43556 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCEO43556 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCEO43556 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCEO43556 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCEO43556 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCEO43556 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCEO43556 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCEO43556 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCEO43556 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCEO43556 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCEO43556 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCEO43556 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCEO43556 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCEO43556 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCEO43556 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCEO43556 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCEO43556 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCEO43556 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCEO43556 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGCEO43556 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGCEO43556 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGCEO43556 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCEO43556 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCEO43556 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCEO43556 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCEO43556 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCEO43556 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCEO43556 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCEO43556 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCEO43556 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCEO43556 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCEO43556 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCEO43556 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCEO43556 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCEO43556 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCEO43556 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCEO43556 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCEO43556 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCEO43556 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCEO43556 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCEO43556 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCEO43556 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCEO43556 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCEO43556 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCEO43556 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCEO43556 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCEO43556 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCEO43556 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCEO43556 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCEO43556 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCEO43556 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCEO43556 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCEO43556 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGCEO43556 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGCEO43556 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGCEO43556 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCEO43556 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCEO43556 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCEO43556 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCEO43556 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCEO43556 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCEO43556 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCEO43556 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCEO43556 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCEO43556 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCEO43556 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCEO43556 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCEO43556 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCEO43556 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCEO43556 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCEO43556 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCEO43556 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCEO43556 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCEO43556 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCEO43556 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCEO43556 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCEO43556 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCEO43556 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCEO43556 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms