Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCF2LO15068 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCF2LO15068 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCF2LO15068 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MCF2LO15068 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCF2LO15068 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCF2LO15068 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCF2LO15068 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCF2LO15068 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCF2LO15068 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MCF2LO15068 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCF2LO15068 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCF2LO15068 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCF2LO15068 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCF2LO15068 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCF2LO15068 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCF2LO15068 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCF2LO15068 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCF2LO15068 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCF2LO15068 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCF2LO15068 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCF2LO15068 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MCF2LO15068 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MCF2LO15068 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCF2LO15068 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCF2LO15068 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCF2LO15068 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCF2LO15068 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCF2LO15068 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCF2LO15068 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCF2LO15068 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCF2LO15068 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MCF2LO15068 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MCF2LO15068 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MCF2LO15068 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCF2LO15068 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCF2LO15068 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCF2LO15068 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCF2LO15068 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCF2LO15068 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCF2LO15068 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCF2LO15068 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCF2LO15068 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCF2LO15068 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCF2LO15068 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MCF2LO15068 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCF2LO15068 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCF2LO15068 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCF2LO15068 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCF2LO15068 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCF2LO15068 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCF2LO15068 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCF2LO15068 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCF2LO15068 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCF2LO15068 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCF2LO15068 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MCF2LO15068 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MCF2LO15068 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCF2LO15068 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCF2LO15068 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms