Protein–RNA interactions for Protein: O15014

ZNF609, Zinc finger protein 609, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF609O15014 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ZNF609O15014 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ZNF609O15014 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZNF609O15014 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
ZNF609O15014 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZNF609O15014 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZNF609O15014 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZNF609O15014 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZNF609O15014 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZNF609O15014 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
ZNF609O15014 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZNF609O15014 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZNF609O15014 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZNF609O15014 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZNF609O15014 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZNF609O15014 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZNF609O15014 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
ZNF609O15014 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF609O15014 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF609O15014 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF609O15014 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF609O15014 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF609O15014 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
ZNF609O15014 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
ZNF609O15014 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZNF609O15014 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ZNF609O15014 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ZNF609O15014 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ZNF609O15014 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ZNF609O15014 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ZNF609O15014 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ZNF609O15014 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ZNF609O15014 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ZNF609O15014 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ZNF609O15014 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ZNF609O15014 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ZNF609O15014 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ZNF609O15014 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ZNF609O15014 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ZNF609O15014 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ZNF609O15014 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ZNF609O15014 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ZNF609O15014 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
ZNF609O15014 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ZNF609O15014 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ZNF609O15014 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ZNF609O15014 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ZNF609O15014 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ZNF609O15014 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ZNF609O15014 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ZNF609O15014 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
ZNF609O15014 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ZNF609O15014 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ZNF609O15014 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ZNF609O15014 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZNF609O15014 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZNF609O15014 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZNF609O15014 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZNF609O15014 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ZNF609O15014 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ZNF609O15014 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ZNF609O15014 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ZNF609O15014 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ZNF609O15014 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
ZNF609O15014 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZNF609O15014 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
ZNF609O15014 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZNF609O15014 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZNF609O15014 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
ZNF609O15014 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZNF609O15014 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZNF609O15014 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZNF609O15014 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZNF609O15014 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZNF609O15014 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZNF609O15014 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZNF609O15014 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
ZNF609O15014 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ZNF609O15014 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ZNF609O15014 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ZNF609O15014 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ZNF609O15014 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ZNF609O15014 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ZNF609O15014 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ZNF609O15014 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ZNF609O15014 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ZNF609O15014 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ZNF609O15014 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ZNF609O15014 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ZNF609O15014 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ZNF609O15014 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ZNF609O15014 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ZNF609O15014 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
ZNF609O15014 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ZNF609O15014 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
ZNF609O15014 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ZNF609O15014 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ZNF609O15014 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ZNF609O15014 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ZNF609O15014 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.2 ms