Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
CUX2O14529 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
CUX2O14529 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.76
CUX2O14529 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
CUX2O14529 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC44.81■■■■■ 4.76
CUX2O14529 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
CUX2O14529 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC44.8■■■■■ 4.76
CUX2O14529 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
CUX2O14529 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
CUX2O14529 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC44.79■■■■■ 4.76
CUX2O14529 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC44.79■■■■■ 4.76
CUX2O14529 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC44.78■■■■■ 4.76
CUX2O14529 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.78■■■■■ 4.76
CUX2O14529 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.78■■■■■ 4.76
CUX2O14529 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC44.78■■■■■ 4.76
CUX2O14529 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
CUX2O14529 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC44.75■■■■■ 4.75
CUX2O14529 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
CUX2O14529 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
CUX2O14529 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC44.74■■■■■ 4.75
CUX2O14529 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
CUX2O14529 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.74
CUX2O14529 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC44.69■■■■■ 4.74
CUX2O14529 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
CUX2O14529 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC44.67■■■■■ 4.74
CUX2O14529 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.67■■■■■ 4.74
CUX2O14529 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
CUX2O14529 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
CUX2O14529 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
CUX2O14529 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC44.64■■■■■ 4.74
CUX2O14529 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC44.64■■■■■ 4.74
CUX2O14529 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC44.64■■■■■ 4.74
CUX2O14529 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC44.64■■■■■ 4.74
CUX2O14529 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC44.62■■■■■ 4.73
CUX2O14529 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC44.62■■■■■ 4.73
CUX2O14529 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
CUX2O14529 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
CUX2O14529 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC44.61■■■■■ 4.73
CUX2O14529 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC44.61■■■■■ 4.73
CUX2O14529 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC44.6■■■■■ 4.73
CUX2O14529 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
CUX2O14529 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
CUX2O14529 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
CUX2O14529 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC44.58■■■■■ 4.73
CUX2O14529 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.57■■■■■ 4.73
CUX2O14529 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
CUX2O14529 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC44.55■■■■■ 4.72
CUX2O14529 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.55■■■■■ 4.72
CUX2O14529 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
CUX2O14529 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC44.54■■■■■ 4.72
CUX2O14529 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
CUX2O14529 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC44.54■■■■■ 4.72
CUX2O14529 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC44.53■■■■■ 4.72
CUX2O14529 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC44.53■■■■■ 4.72
CUX2O14529 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
CUX2O14529 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
CUX2O14529 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.52■■■■■ 4.72
CUX2O14529 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
CUX2O14529 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC44.52■■■■■ 4.72
CUX2O14529 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC44.52■■■■■ 4.72
CUX2O14529 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC44.52■■■■■ 4.72
CUX2O14529 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC44.52■■■■■ 4.72
CUX2O14529 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC44.51■■■■■ 4.72
CUX2O14529 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
CUX2O14529 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
CUX2O14529 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
CUX2O14529 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC44.47■■■■■ 4.71
CUX2O14529 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC44.46■■■■■ 4.71
CUX2O14529 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.46■■■■■ 4.71
CUX2O14529 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
CUX2O14529 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
CUX2O14529 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
CUX2O14529 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
CUX2O14529 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
CUX2O14529 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
CUX2O14529 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
CUX2O14529 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
CUX2O14529 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
CUX2O14529 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
CUX2O14529 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
CUX2O14529 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
CUX2O14529 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC44.43■■■■■ 4.7
CUX2O14529 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC44.42■■■■■ 4.7
CUX2O14529 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
CUX2O14529 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
CUX2O14529 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
CUX2O14529 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
CUX2O14529 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
CUX2O14529 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
CUX2O14529 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
CUX2O14529 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC44.39■■■■■ 4.7
CUX2O14529 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC44.39■■■■■ 4.7
CUX2O14529 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
CUX2O14529 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
CUX2O14529 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
CUX2O14529 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
CUX2O14529 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
CUX2O14529 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
CUX2O14529 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.37■■■■■ 4.69
CUX2O14529 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC44.37■■■■■ 4.69
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