Protein–RNA interactions for Protein: O00626

CCL22, C-C motif chemokine 22, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL22O00626 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCL22O00626 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCL22O00626 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCL22O00626 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCL22O00626 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCL22O00626 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCL22O00626 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCL22O00626 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCL22O00626 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCL22O00626 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCL22O00626 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCL22O00626 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCL22O00626 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCL22O00626 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCL22O00626 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCL22O00626 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCL22O00626 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCL22O00626 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCL22O00626 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCL22O00626 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCL22O00626 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCL22O00626 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCL22O00626 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCL22O00626 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCL22O00626 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCL22O00626 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCL22O00626 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCL22O00626 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCL22O00626 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCL22O00626 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCL22O00626 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCL22O00626 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCL22O00626 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCL22O00626 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCL22O00626 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCL22O00626 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCL22O00626 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCL22O00626 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCL22O00626 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCL22O00626 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCL22O00626 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCL22O00626 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCL22O00626 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCL22O00626 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCL22O00626 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCL22O00626 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCL22O00626 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCL22O00626 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCL22O00626 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCL22O00626 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCL22O00626 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCL22O00626 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCL22O00626 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCL22O00626 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCL22O00626 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCL22O00626 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCL22O00626 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCL22O00626 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCL22O00626 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCL22O00626 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCL22O00626 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCL22O00626 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCL22O00626 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCL22O00626 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCL22O00626 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCL22O00626 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCL22O00626 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCL22O00626 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCL22O00626 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCL22O00626 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCL22O00626 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCL22O00626 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCL22O00626 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCL22O00626 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCL22O00626 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCL22O00626 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCL22O00626 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCL22O00626 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCL22O00626 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCL22O00626 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCL22O00626 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCL22O00626 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCL22O00626 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCL22O00626 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCL22O00626 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCL22O00626 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCL22O00626 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCL22O00626 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCL22O00626 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL22O00626 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL22O00626 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL22O00626 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL22O00626 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL22O00626 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCL22O00626 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCL22O00626 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCL22O00626 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCL22O00626 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCL22O00626 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCL22O00626 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms