Protein–RNA interactions for Protein: O00499

BIN1, Myc box-dependent-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN1O00499 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BIN1O00499 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
BIN1O00499 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BIN1O00499 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BIN1O00499 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BIN1O00499 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BIN1O00499 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BIN1O00499 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BIN1O00499 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BIN1O00499 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BIN1O00499 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BIN1O00499 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BIN1O00499 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BIN1O00499 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
BIN1O00499 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BIN1O00499 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BIN1O00499 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BIN1O00499 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BIN1O00499 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BIN1O00499 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BIN1O00499 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BIN1O00499 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BIN1O00499 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
BIN1O00499 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BIN1O00499 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BIN1O00499 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BIN1O00499 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BIN1O00499 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BIN1O00499 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BIN1O00499 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BIN1O00499 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BIN1O00499 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BIN1O00499 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BIN1O00499 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
BIN1O00499 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BIN1O00499 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BIN1O00499 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BIN1O00499 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
BIN1O00499 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BIN1O00499 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BIN1O00499 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
BIN1O00499 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
BIN1O00499 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BIN1O00499 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
BIN1O00499 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BIN1O00499 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BIN1O00499 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BIN1O00499 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BIN1O00499 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BIN1O00499 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BIN1O00499 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BIN1O00499 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BIN1O00499 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BIN1O00499 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BIN1O00499 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BIN1O00499 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BIN1O00499 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BIN1O00499 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BIN1O00499 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BIN1O00499 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BIN1O00499 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BIN1O00499 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BIN1O00499 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BIN1O00499 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BIN1O00499 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BIN1O00499 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BIN1O00499 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BIN1O00499 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
BIN1O00499 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BIN1O00499 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BIN1O00499 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BIN1O00499 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BIN1O00499 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
BIN1O00499 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BIN1O00499 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BIN1O00499 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BIN1O00499 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BIN1O00499 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BIN1O00499 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BIN1O00499 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BIN1O00499 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BIN1O00499 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BIN1O00499 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BIN1O00499 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BIN1O00499 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
BIN1O00499 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
BIN1O00499 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
BIN1O00499 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BIN1O00499 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BIN1O00499 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BIN1O00499 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BIN1O00499 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BIN1O00499 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BIN1O00499 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BIN1O00499 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BIN1O00499 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BIN1O00499 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
BIN1O00499 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BIN1O00499 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BIN1O00499 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms