Protein–RNA interactions for Protein: O00409

FOXN3, Forkhead box protein N3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3O00409 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXN3O00409 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXN3O00409 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXN3O00409 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXN3O00409 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXN3O00409 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXN3O00409 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXN3O00409 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXN3O00409 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXN3O00409 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXN3O00409 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXN3O00409 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXN3O00409 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXN3O00409 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXN3O00409 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXN3O00409 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXN3O00409 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXN3O00409 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXN3O00409 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXN3O00409 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXN3O00409 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXN3O00409 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXN3O00409 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXN3O00409 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXN3O00409 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXN3O00409 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXN3O00409 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXN3O00409 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXN3O00409 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXN3O00409 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXN3O00409 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXN3O00409 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXN3O00409 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXN3O00409 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXN3O00409 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXN3O00409 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXN3O00409 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXN3O00409 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXN3O00409 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXN3O00409 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXN3O00409 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXN3O00409 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXN3O00409 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXN3O00409 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXN3O00409 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXN3O00409 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXN3O00409 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXN3O00409 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXN3O00409 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXN3O00409 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXN3O00409 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXN3O00409 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXN3O00409 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXN3O00409 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXN3O00409 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXN3O00409 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXN3O00409 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXN3O00409 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXN3O00409 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXN3O00409 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXN3O00409 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXN3O00409 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXN3O00409 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXN3O00409 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXN3O00409 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXN3O00409 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXN3O00409 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXN3O00409 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXN3O00409 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXN3O00409 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXN3O00409 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXN3O00409 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXN3O00409 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXN3O00409 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXN3O00409 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXN3O00409 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXN3O00409 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXN3O00409 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXN3O00409 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXN3O00409 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXN3O00409 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXN3O00409 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXN3O00409 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXN3O00409 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXN3O00409 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXN3O00409 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXN3O00409 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXN3O00409 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXN3O00409 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXN3O00409 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXN3O00409 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXN3O00409 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXN3O00409 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXN3O00409 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXN3O00409 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXN3O00409 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXN3O00409 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXN3O00409 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXN3O00409 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXN3O00409 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms