Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFRSF10AO00220 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNFRSF10AO00220 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNFRSF10AO00220 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNFRSF10AO00220 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFRSF10AO00220 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFRSF10AO00220 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFRSF10AO00220 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFRSF10AO00220 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFRSF10AO00220 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFRSF10AO00220 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFRSF10AO00220 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFRSF10AO00220 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFRSF10AO00220 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFRSF10AO00220 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFRSF10AO00220 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFRSF10AO00220 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFRSF10AO00220 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFRSF10AO00220 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFRSF10AO00220 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFRSF10AO00220 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFRSF10AO00220 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFRSF10AO00220 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFRSF10AO00220 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFRSF10AO00220 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFRSF10AO00220 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFRSF10AO00220 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFRSF10AO00220 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFRSF10AO00220 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFRSF10AO00220 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFRSF10AO00220 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFRSF10AO00220 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFRSF10AO00220 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFRSF10AO00220 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFRSF10AO00220 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFRSF10AO00220 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFRSF10AO00220 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFRSF10AO00220 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFRSF10AO00220 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFRSF10AO00220 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFRSF10AO00220 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFRSF10AO00220 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFRSF10AO00220 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFRSF10AO00220 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFRSF10AO00220 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFRSF10AO00220 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFRSF10AO00220 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFRSF10AO00220 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFRSF10AO00220 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFRSF10AO00220 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFRSF10AO00220 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFRSF10AO00220 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFRSF10AO00220 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFRSF10AO00220 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFRSF10AO00220 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFRSF10AO00220 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFRSF10AO00220 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFRSF10AO00220 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNFRSF10AO00220 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNFRSF10AO00220 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNFRSF10AO00220 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNFRSF10AO00220 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNFRSF10AO00220 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFRSF10AO00220 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFRSF10AO00220 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFRSF10AO00220 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFRSF10AO00220 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFRSF10AO00220 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFRSF10AO00220 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFRSF10AO00220 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFRSF10AO00220 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFRSF10AO00220 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFRSF10AO00220 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFRSF10AO00220 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFRSF10AO00220 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFRSF10AO00220 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFRSF10AO00220 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFRSF10AO00220 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFRSF10AO00220 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFRSF10AO00220 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFRSF10AO00220 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFRSF10AO00220 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFRSF10AO00220 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFRSF10AO00220 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFRSF10AO00220 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFRSF10AO00220 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFRSF10AO00220 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFRSF10AO00220 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFRSF10AO00220 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFRSF10AO00220 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFRSF10AO00220 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFRSF10AO00220 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFRSF10AO00220 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFRSF10AO00220 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFRSF10AO00220 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFRSF10AO00220 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFRSF10AO00220 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFRSF10AO00220 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFRSF10AO00220 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFRSF10AO00220 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms