Protein–RNA interactions for Protein: J3QT63

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QT63 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
J3QT63 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3QT63 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QT63 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QT63 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QT63 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3QT63 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3QT63 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3QT63 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QT63 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QT63 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QT63 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QT63 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QT63 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QT63 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QT63 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QT63 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QT63 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QT63 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
J3QT63 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QT63 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QT63 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QT63 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QT63 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QT63 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QT63 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QT63 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QT63 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QT63 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QT63 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QT63 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QT63 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QT63 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QT63 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QT63 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QT63 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QT63 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QT63 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QT63 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QT63 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QT63 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QT63 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QT63 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QT63 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QT63 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QT63 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3QT63 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3QT63 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3QT63 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3QT63 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3QT63 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QT63 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QT63 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QT63 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QT63 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QT63 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QT63 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QT63 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3QT63 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3QT63 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3QT63 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3QT63 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3QT63 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3QT63 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3QT63 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3QT63 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3QT63 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3QT63 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QT63 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QT63 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QT63 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QT63 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QT63 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QT63 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3QT63 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3QT63 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
J3QT63 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
J3QT63 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3QT63 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3QT63 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3QT63 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3QT63 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3QT63 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3QT63 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3QT63 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3QT63 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3QT63 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3QT63 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3QT63 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3QT63 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3QT63 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3QT63 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3QT63 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QT63 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QT63 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QT63 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QT63 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QT63 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3QT63 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3QT63 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms