Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM1B2RUZ4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM1B2RUZ4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM1B2RUZ4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM1B2RUZ4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM1B2RUZ4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM1B2RUZ4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM1B2RUZ4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM1B2RUZ4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM1B2RUZ4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM1B2RUZ4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM1B2RUZ4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM1B2RUZ4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM1B2RUZ4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM1B2RUZ4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM1B2RUZ4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM1B2RUZ4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM1B2RUZ4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SMIM1B2RUZ4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMIM1B2RUZ4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM1B2RUZ4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM1B2RUZ4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM1B2RUZ4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM1B2RUZ4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM1B2RUZ4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM1B2RUZ4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM1B2RUZ4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM1B2RUZ4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM1B2RUZ4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM1B2RUZ4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM1B2RUZ4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM1B2RUZ4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM1B2RUZ4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM1B2RUZ4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM1B2RUZ4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM1B2RUZ4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM1B2RUZ4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM1B2RUZ4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM1B2RUZ4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM1B2RUZ4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM1B2RUZ4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM1B2RUZ4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM1B2RUZ4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM1B2RUZ4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM1B2RUZ4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM1B2RUZ4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM1B2RUZ4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM1B2RUZ4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM1B2RUZ4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM1B2RUZ4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM1B2RUZ4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms