Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC00587B1AMM8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC00587B1AMM8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC00587B1AMM8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC00587B1AMM8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC00587B1AMM8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC00587B1AMM8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00587B1AMM8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00587B1AMM8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00587B1AMM8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LINC00587B1AMM8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00587B1AMM8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00587B1AMM8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00587B1AMM8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00587B1AMM8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00587B1AMM8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00587B1AMM8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00587B1AMM8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00587B1AMM8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00587B1AMM8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00587B1AMM8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00587B1AMM8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00587B1AMM8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00587B1AMM8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00587B1AMM8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00587B1AMM8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00587B1AMM8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00587B1AMM8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00587B1AMM8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00587B1AMM8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00587B1AMM8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00587B1AMM8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00587B1AMM8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms