Protein–RNA interactions for Protein: A8MV23

SERPINE3, Serpin E3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINE3A8MV23 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINE3A8MV23 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINE3A8MV23 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINE3A8MV23 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINE3A8MV23 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINE3A8MV23 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINE3A8MV23 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINE3A8MV23 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINE3A8MV23 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINE3A8MV23 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINE3A8MV23 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINE3A8MV23 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINE3A8MV23 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINE3A8MV23 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINE3A8MV23 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINE3A8MV23 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINE3A8MV23 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINE3A8MV23 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINE3A8MV23 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPINE3A8MV23 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPINE3A8MV23 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPINE3A8MV23 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPINE3A8MV23 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPINE3A8MV23 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPINE3A8MV23 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINE3A8MV23 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINE3A8MV23 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINE3A8MV23 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINE3A8MV23 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINE3A8MV23 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINE3A8MV23 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINE3A8MV23 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINE3A8MV23 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINE3A8MV23 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINE3A8MV23 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINE3A8MV23 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SERPINE3A8MV23 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPINE3A8MV23 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SERPINE3A8MV23 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINE3A8MV23 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINE3A8MV23 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SERPINE3A8MV23 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINE3A8MV23 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINE3A8MV23 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINE3A8MV23 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINE3A8MV23 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINE3A8MV23 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINE3A8MV23 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINE3A8MV23 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINE3A8MV23 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINE3A8MV23 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINE3A8MV23 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINE3A8MV23 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINE3A8MV23 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SERPINE3A8MV23 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINE3A8MV23 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINE3A8MV23 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINE3A8MV23 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINE3A8MV23 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINE3A8MV23 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERPINE3A8MV23 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERPINE3A8MV23 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SERPINE3A8MV23 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SERPINE3A8MV23 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SERPINE3A8MV23 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERPINE3A8MV23 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SERPINE3A8MV23 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SERPINE3A8MV23 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms