Protein–RNA interactions for Protein: A6NNX1

RIIAD1, RIIa domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIIAD1A6NNX1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIIAD1A6NNX1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIIAD1A6NNX1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIIAD1A6NNX1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIIAD1A6NNX1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIIAD1A6NNX1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIIAD1A6NNX1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIIAD1A6NNX1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIIAD1A6NNX1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIIAD1A6NNX1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIIAD1A6NNX1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIIAD1A6NNX1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIIAD1A6NNX1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIIAD1A6NNX1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIIAD1A6NNX1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIIAD1A6NNX1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIIAD1A6NNX1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIIAD1A6NNX1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIIAD1A6NNX1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIIAD1A6NNX1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIIAD1A6NNX1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIIAD1A6NNX1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIIAD1A6NNX1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RIIAD1A6NNX1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIIAD1A6NNX1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIIAD1A6NNX1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIIAD1A6NNX1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIIAD1A6NNX1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIIAD1A6NNX1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIIAD1A6NNX1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIIAD1A6NNX1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIIAD1A6NNX1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIIAD1A6NNX1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIIAD1A6NNX1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIIAD1A6NNX1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIIAD1A6NNX1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIIAD1A6NNX1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIIAD1A6NNX1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIIAD1A6NNX1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIIAD1A6NNX1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIIAD1A6NNX1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIIAD1A6NNX1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIIAD1A6NNX1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIIAD1A6NNX1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIIAD1A6NNX1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIIAD1A6NNX1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIIAD1A6NNX1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIIAD1A6NNX1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIIAD1A6NNX1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RIIAD1A6NNX1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RIIAD1A6NNX1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIIAD1A6NNX1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RIIAD1A6NNX1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIIAD1A6NNX1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIIAD1A6NNX1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIIAD1A6NNX1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIIAD1A6NNX1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIIAD1A6NNX1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIIAD1A6NNX1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIIAD1A6NNX1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIIAD1A6NNX1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIIAD1A6NNX1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIIAD1A6NNX1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIIAD1A6NNX1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIIAD1A6NNX1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms