Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRRM3A6NNA2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRRM3A6NNA2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRRM3A6NNA2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRRM3A6NNA2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRRM3A6NNA2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRRM3A6NNA2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRRM3A6NNA2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRRM3A6NNA2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRRM3A6NNA2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRRM3A6NNA2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRRM3A6NNA2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRRM3A6NNA2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRRM3A6NNA2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRRM3A6NNA2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRRM3A6NNA2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRRM3A6NNA2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRRM3A6NNA2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRRM3A6NNA2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRRM3A6NNA2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRRM3A6NNA2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRRM3A6NNA2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRRM3A6NNA2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRRM3A6NNA2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRRM3A6NNA2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRRM3A6NNA2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRRM3A6NNA2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRRM3A6NNA2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRRM3A6NNA2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRRM3A6NNA2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SRRM3A6NNA2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRRM3A6NNA2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRRM3A6NNA2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SRRM3A6NNA2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRRM3A6NNA2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRRM3A6NNA2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRRM3A6NNA2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRRM3A6NNA2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRRM3A6NNA2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRRM3A6NNA2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRRM3A6NNA2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRRM3A6NNA2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRRM3A6NNA2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRRM3A6NNA2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRRM3A6NNA2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRRM3A6NNA2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRRM3A6NNA2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRRM3A6NNA2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRRM3A6NNA2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRRM3A6NNA2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRRM3A6NNA2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRRM3A6NNA2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRRM3A6NNA2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRRM3A6NNA2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRRM3A6NNA2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRRM3A6NNA2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SRRM3A6NNA2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRRM3A6NNA2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRRM3A6NNA2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRRM3A6NNA2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRRM3A6NNA2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRRM3A6NNA2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRRM3A6NNA2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRRM3A6NNA2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRRM3A6NNA2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRRM3A6NNA2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRRM3A6NNA2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRRM3A6NNA2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRRM3A6NNA2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRRM3A6NNA2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRRM3A6NNA2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRRM3A6NNA2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRRM3A6NNA2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRRM3A6NNA2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRRM3A6NNA2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRRM3A6NNA2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRRM3A6NNA2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRRM3A6NNA2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRRM3A6NNA2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRRM3A6NNA2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRRM3A6NNA2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SRRM3A6NNA2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRRM3A6NNA2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRRM3A6NNA2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRRM3A6NNA2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRRM3A6NNA2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRRM3A6NNA2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRRM3A6NNA2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRRM3A6NNA2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRM3A6NNA2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRM3A6NNA2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRM3A6NNA2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRM3A6NNA2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms