Protein–RNA interactions for Protein: A6NMB1

SIGLEC16, Sialic acid-binding Ig-like lectin 16, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGLEC16A6NMB1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIGLEC16A6NMB1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIGLEC16A6NMB1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIGLEC16A6NMB1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIGLEC16A6NMB1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIGLEC16A6NMB1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SIGLEC16A6NMB1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIGLEC16A6NMB1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIGLEC16A6NMB1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIGLEC16A6NMB1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIGLEC16A6NMB1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIGLEC16A6NMB1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIGLEC16A6NMB1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIGLEC16A6NMB1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIGLEC16A6NMB1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIGLEC16A6NMB1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIGLEC16A6NMB1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SIGLEC16A6NMB1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIGLEC16A6NMB1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIGLEC16A6NMB1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIGLEC16A6NMB1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIGLEC16A6NMB1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIGLEC16A6NMB1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIGLEC16A6NMB1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIGLEC16A6NMB1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIGLEC16A6NMB1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIGLEC16A6NMB1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIGLEC16A6NMB1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIGLEC16A6NMB1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIGLEC16A6NMB1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIGLEC16A6NMB1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIGLEC16A6NMB1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SIGLEC16A6NMB1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIGLEC16A6NMB1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIGLEC16A6NMB1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SIGLEC16A6NMB1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SIGLEC16A6NMB1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIGLEC16A6NMB1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIGLEC16A6NMB1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIGLEC16A6NMB1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIGLEC16A6NMB1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIGLEC16A6NMB1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIGLEC16A6NMB1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIGLEC16A6NMB1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIGLEC16A6NMB1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIGLEC16A6NMB1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIGLEC16A6NMB1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIGLEC16A6NMB1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIGLEC16A6NMB1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIGLEC16A6NMB1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIGLEC16A6NMB1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIGLEC16A6NMB1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SIGLEC16A6NMB1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SIGLEC16A6NMB1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIGLEC16A6NMB1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIGLEC16A6NMB1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIGLEC16A6NMB1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIGLEC16A6NMB1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIGLEC16A6NMB1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIGLEC16A6NMB1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SIGLEC16A6NMB1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIGLEC16A6NMB1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIGLEC16A6NMB1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIGLEC16A6NMB1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIGLEC16A6NMB1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIGLEC16A6NMB1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIGLEC16A6NMB1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIGLEC16A6NMB1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIGLEC16A6NMB1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIGLEC16A6NMB1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIGLEC16A6NMB1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIGLEC16A6NMB1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIGLEC16A6NMB1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIGLEC16A6NMB1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIGLEC16A6NMB1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIGLEC16A6NMB1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIGLEC16A6NMB1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIGLEC16A6NMB1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIGLEC16A6NMB1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIGLEC16A6NMB1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIGLEC16A6NMB1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIGLEC16A6NMB1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIGLEC16A6NMB1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIGLEC16A6NMB1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIGLEC16A6NMB1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SIGLEC16A6NMB1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIGLEC16A6NMB1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIGLEC16A6NMB1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIGLEC16A6NMB1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIGLEC16A6NMB1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIGLEC16A6NMB1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIGLEC16A6NMB1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIGLEC16A6NMB1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIGLEC16A6NMB1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIGLEC16A6NMB1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIGLEC16A6NMB1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIGLEC16A6NMB1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIGLEC16A6NMB1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIGLEC16A6NMB1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIGLEC16A6NMB1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms