Protein–RNA interactions for Protein: A6NK06

ACOD1, Cis-aconitate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOD1A6NK06 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACOD1A6NK06 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACOD1A6NK06 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACOD1A6NK06 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACOD1A6NK06 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACOD1A6NK06 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACOD1A6NK06 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACOD1A6NK06 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACOD1A6NK06 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACOD1A6NK06 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACOD1A6NK06 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACOD1A6NK06 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACOD1A6NK06 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACOD1A6NK06 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACOD1A6NK06 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACOD1A6NK06 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACOD1A6NK06 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACOD1A6NK06 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACOD1A6NK06 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACOD1A6NK06 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACOD1A6NK06 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACOD1A6NK06 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACOD1A6NK06 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ACOD1A6NK06 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACOD1A6NK06 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACOD1A6NK06 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACOD1A6NK06 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACOD1A6NK06 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACOD1A6NK06 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACOD1A6NK06 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACOD1A6NK06 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACOD1A6NK06 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACOD1A6NK06 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACOD1A6NK06 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACOD1A6NK06 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACOD1A6NK06 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms