Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GMNCA6NCL1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GMNCA6NCL1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GMNCA6NCL1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GMNCA6NCL1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GMNCA6NCL1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GMNCA6NCL1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GMNCA6NCL1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GMNCA6NCL1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GMNCA6NCL1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GMNCA6NCL1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GMNCA6NCL1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GMNCA6NCL1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GMNCA6NCL1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GMNCA6NCL1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GMNCA6NCL1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GMNCA6NCL1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GMNCA6NCL1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GMNCA6NCL1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GMNCA6NCL1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GMNCA6NCL1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GMNCA6NCL1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GMNCA6NCL1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GMNCA6NCL1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GMNCA6NCL1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GMNCA6NCL1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GMNCA6NCL1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GMNCA6NCL1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GMNCA6NCL1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GMNCA6NCL1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GMNCA6NCL1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GMNCA6NCL1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GMNCA6NCL1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GMNCA6NCL1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GMNCA6NCL1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GMNCA6NCL1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GMNCA6NCL1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GMNCA6NCL1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GMNCA6NCL1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GMNCA6NCL1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GMNCA6NCL1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GMNCA6NCL1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GMNCA6NCL1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GMNCA6NCL1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GMNCA6NCL1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GMNCA6NCL1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GMNCA6NCL1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GMNCA6NCL1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GMNCA6NCL1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GMNCA6NCL1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GMNCA6NCL1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GMNCA6NCL1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GMNCA6NCL1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GMNCA6NCL1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GMNCA6NCL1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GMNCA6NCL1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GMNCA6NCL1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GMNCA6NCL1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GMNCA6NCL1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GMNCA6NCL1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GMNCA6NCL1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GMNCA6NCL1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GMNCA6NCL1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GMNCA6NCL1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GMNCA6NCL1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GMNCA6NCL1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GMNCA6NCL1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GMNCA6NCL1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GMNCA6NCL1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GMNCA6NCL1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GMNCA6NCL1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GMNCA6NCL1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GMNCA6NCL1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GMNCA6NCL1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GMNCA6NCL1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GMNCA6NCL1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GMNCA6NCL1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GMNCA6NCL1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GMNCA6NCL1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GMNCA6NCL1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GMNCA6NCL1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GMNCA6NCL1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GMNCA6NCL1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GMNCA6NCL1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GMNCA6NCL1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GMNCA6NCL1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GMNCA6NCL1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GMNCA6NCL1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GMNCA6NCL1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GMNCA6NCL1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GMNCA6NCL1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GMNCA6NCL1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GMNCA6NCL1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GMNCA6NCL1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GMNCA6NCL1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GMNCA6NCL1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GMNCA6NCL1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GMNCA6NCL1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GMNCA6NCL1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GMNCA6NCL1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms