Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EME2A4GXA9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EME2A4GXA9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EME2A4GXA9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EME2A4GXA9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EME2A4GXA9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EME2A4GXA9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EME2A4GXA9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EME2A4GXA9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EME2A4GXA9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EME2A4GXA9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EME2A4GXA9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EME2A4GXA9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EME2A4GXA9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EME2A4GXA9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EME2A4GXA9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EME2A4GXA9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EME2A4GXA9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EME2A4GXA9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EME2A4GXA9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EME2A4GXA9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EME2A4GXA9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EME2A4GXA9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EME2A4GXA9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EME2A4GXA9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EME2A4GXA9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EME2A4GXA9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EME2A4GXA9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EME2A4GXA9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EME2A4GXA9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EME2A4GXA9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EME2A4GXA9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EME2A4GXA9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EME2A4GXA9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EME2A4GXA9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EME2A4GXA9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EME2A4GXA9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EME2A4GXA9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EME2A4GXA9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EME2A4GXA9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EME2A4GXA9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EME2A4GXA9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EME2A4GXA9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EME2A4GXA9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EME2A4GXA9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EME2A4GXA9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EME2A4GXA9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EME2A4GXA9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EME2A4GXA9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EME2A4GXA9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EME2A4GXA9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EME2A4GXA9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EME2A4GXA9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EME2A4GXA9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EME2A4GXA9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EME2A4GXA9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EME2A4GXA9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EME2A4GXA9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EME2A4GXA9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EME2A4GXA9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EME2A4GXA9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EME2A4GXA9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EME2A4GXA9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EME2A4GXA9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms