Protein–RNA interactions for Protein: A0PK05

TMEM72, Transmembrane protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM72A0PK05 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM72A0PK05 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM72A0PK05 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM72A0PK05 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM72A0PK05 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM72A0PK05 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM72A0PK05 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM72A0PK05 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM72A0PK05 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM72A0PK05 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM72A0PK05 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM72A0PK05 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM72A0PK05 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM72A0PK05 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM72A0PK05 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM72A0PK05 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM72A0PK05 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM72A0PK05 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM72A0PK05 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM72A0PK05 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM72A0PK05 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM72A0PK05 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM72A0PK05 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM72A0PK05 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM72A0PK05 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM72A0PK05 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM72A0PK05 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM72A0PK05 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM72A0PK05 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM72A0PK05 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM72A0PK05 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM72A0PK05 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM72A0PK05 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM72A0PK05 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM72A0PK05 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM72A0PK05 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM72A0PK05 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM72A0PK05 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM72A0PK05 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM72A0PK05 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM72A0PK05 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM72A0PK05 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM72A0PK05 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM72A0PK05 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM72A0PK05 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM72A0PK05 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM72A0PK05 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM72A0PK05 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM72A0PK05 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM72A0PK05 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM72A0PK05 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM72A0PK05 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM72A0PK05 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM72A0PK05 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM72A0PK05 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM72A0PK05 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM72A0PK05 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM72A0PK05 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM72A0PK05 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM72A0PK05 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM72A0PK05 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM72A0PK05 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM72A0PK05 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM72A0PK05 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM72A0PK05 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM72A0PK05 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM72A0PK05 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM72A0PK05 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM72A0PK05 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM72A0PK05 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM72A0PK05 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM72A0PK05 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM72A0PK05 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM72A0PK05 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM72A0PK05 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM72A0PK05 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM72A0PK05 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM72A0PK05 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM72A0PK05 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM72A0PK05 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM72A0PK05 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM72A0PK05 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms