Protein–RNA interactions for Protein: A0A578

TCRBV5S1A1T, T-cell receptor beta variable 5-1 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S1A1TA0A578 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TCRBV5S1A1TA0A578 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCRBV5S1A1TA0A578 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCRBV5S1A1TA0A578 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCRBV5S1A1TA0A578 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCRBV5S1A1TA0A578 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCRBV5S1A1TA0A578 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCRBV5S1A1TA0A578 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCRBV5S1A1TA0A578 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCRBV5S1A1TA0A578 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TCRBV5S1A1TA0A578 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCRBV5S1A1TA0A578 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCRBV5S1A1TA0A578 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCRBV5S1A1TA0A578 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCRBV5S1A1TA0A578 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCRBV5S1A1TA0A578 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCRBV5S1A1TA0A578 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCRBV5S1A1TA0A578 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCRBV5S1A1TA0A578 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCRBV5S1A1TA0A578 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCRBV5S1A1TA0A578 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCRBV5S1A1TA0A578 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCRBV5S1A1TA0A578 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCRBV5S1A1TA0A578 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCRBV5S1A1TA0A578 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCRBV5S1A1TA0A578 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCRBV5S1A1TA0A578 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCRBV5S1A1TA0A578 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCRBV5S1A1TA0A578 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCRBV5S1A1TA0A578 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCRBV5S1A1TA0A578 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCRBV5S1A1TA0A578 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCRBV5S1A1TA0A578 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCRBV5S1A1TA0A578 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCRBV5S1A1TA0A578 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCRBV5S1A1TA0A578 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCRBV5S1A1TA0A578 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TCRBV5S1A1TA0A578 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCRBV5S1A1TA0A578 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCRBV5S1A1TA0A578 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TCRBV5S1A1TA0A578 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TCRBV5S1A1TA0A578 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TCRBV5S1A1TA0A578 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TCRBV5S1A1TA0A578 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCRBV5S1A1TA0A578 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCRBV5S1A1TA0A578 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCRBV5S1A1TA0A578 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCRBV5S1A1TA0A578 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCRBV5S1A1TA0A578 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCRBV5S1A1TA0A578 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCRBV5S1A1TA0A578 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCRBV5S1A1TA0A578 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCRBV5S1A1TA0A578 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCRBV5S1A1TA0A578 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCRBV5S1A1TA0A578 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCRBV5S1A1TA0A578 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCRBV5S1A1TA0A578 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TCRBV5S1A1TA0A578 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCRBV5S1A1TA0A578 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCRBV5S1A1TA0A578 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCRBV5S1A1TA0A578 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCRBV5S1A1TA0A578 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCRBV5S1A1TA0A578 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
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TCRBV5S1A1TA0A578 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCRBV5S1A1TA0A578 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCRBV5S1A1TA0A578 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCRBV5S1A1TA0A578 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCRBV5S1A1TA0A578 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCRBV5S1A1TA0A578 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TCRBV5S1A1TA0A578 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCRBV5S1A1TA0A578 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCRBV5S1A1TA0A578 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCRBV5S1A1TA0A578 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCRBV5S1A1TA0A578 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCRBV5S1A1TA0A578 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCRBV5S1A1TA0A578 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCRBV5S1A1TA0A578 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCRBV5S1A1TA0A578 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCRBV5S1A1TA0A578 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCRBV5S1A1TA0A578 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCRBV5S1A1TA0A578 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCRBV5S1A1TA0A578 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCRBV5S1A1TA0A578 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCRBV5S1A1TA0A578 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCRBV5S1A1TA0A578 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCRBV5S1A1TA0A578 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCRBV5S1A1TA0A578 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCRBV5S1A1TA0A578 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCRBV5S1A1TA0A578 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
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TCRBV5S1A1TA0A578 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCRBV5S1A1TA0A578 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCRBV5S1A1TA0A578 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCRBV5S1A1TA0A578 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
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