Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J238

TRAV1-2, T-cell receptor alpha variable 1-2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV1-2A0A0B4J238 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAV1-2A0A0B4J238 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAV1-2A0A0B4J238 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAV1-2A0A0B4J238 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAV1-2A0A0B4J238 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAV1-2A0A0B4J238 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAV1-2A0A0B4J238 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAV1-2A0A0B4J238 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAV1-2A0A0B4J238 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAV1-2A0A0B4J238 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAV1-2A0A0B4J238 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAV1-2A0A0B4J238 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAV1-2A0A0B4J238 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAV1-2A0A0B4J238 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAV1-2A0A0B4J238 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAV1-2A0A0B4J238 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAV1-2A0A0B4J238 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAV1-2A0A0B4J238 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAV1-2A0A0B4J238 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAV1-2A0A0B4J238 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAV1-2A0A0B4J238 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAV1-2A0A0B4J238 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAV1-2A0A0B4J238 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAV1-2A0A0B4J238 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAV1-2A0A0B4J238 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAV1-2A0A0B4J238 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAV1-2A0A0B4J238 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAV1-2A0A0B4J238 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAV1-2A0A0B4J238 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAV1-2A0A0B4J238 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAV1-2A0A0B4J238 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAV1-2A0A0B4J238 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAV1-2A0A0B4J238 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAV1-2A0A0B4J238 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAV1-2A0A0B4J238 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAV1-2A0A0B4J238 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAV1-2A0A0B4J238 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAV1-2A0A0B4J238 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAV1-2A0A0B4J238 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAV1-2A0A0B4J238 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAV1-2A0A0B4J238 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAV1-2A0A0B4J238 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAV1-2A0A0B4J238 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAV1-2A0A0B4J238 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAV1-2A0A0B4J238 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAV1-2A0A0B4J238 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAV1-2A0A0B4J238 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAV1-2A0A0B4J238 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAV1-2A0A0B4J238 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAV1-2A0A0B4J238 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAV1-2A0A0B4J238 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAV1-2A0A0B4J238 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAV1-2A0A0B4J238 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAV1-2A0A0B4J238 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAV1-2A0A0B4J238 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAV1-2A0A0B4J238 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAV1-2A0A0B4J238 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAV1-2A0A0B4J238 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAV1-2A0A0B4J238 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAV1-2A0A0B4J238 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAV1-2A0A0B4J238 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAV1-2A0A0B4J238 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAV1-2A0A0B4J238 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAV1-2A0A0B4J238 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAV1-2A0A0B4J238 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAV1-2A0A0B4J238 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAV1-2A0A0B4J238 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAV1-2A0A0B4J238 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms