Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1Z2

IGKV1D-43, Immunoglobulin kappa variable 1D-43, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms