Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0T9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0T9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A087X0T9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A087X0T9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A087X0T9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A087X0T9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A087X0T9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A087X0T9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A087X0T9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A087X0T9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A087X0T9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A087X0T9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A087X0T9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A087X0T9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
A0A087X0T9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
A0A087X0T9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
A0A087X0T9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A087X0T9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A087X0T9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A087X0T9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A087X0T9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A087X0T9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A087X0T9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A087X0T9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A087X0T9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A087X0T9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A087X0T9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A087X0T9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A087X0T9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A087X0T9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A087X0T9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A087X0T9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A087X0T9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A087X0T9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A087X0T9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A087X0T9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A087X0T9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A087X0T9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A087X0T9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A087X0T9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A087X0T9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A087X0T9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A087X0T9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A087X0T9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A087X0T9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A087X0T9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A087X0T9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A087X0T9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A087X0T9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A087X0T9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A087X0T9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
A0A087X0T9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
A0A087X0T9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A087X0T9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A087X0T9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A087X0T9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
A0A087X0T9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A087X0T9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A087X0T9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A087X0T9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A087X0T9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A087X0T9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
A0A087X0T9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A087X0T9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A087X0T9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A087X0T9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A087X0T9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A087X0T9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A087X0T9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A087X0T9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A087X0T9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A087X0T9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A087X0T9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A087X0T9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A087X0T9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A087X0T9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
A0A087X0T9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A087X0T9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A087X0T9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A087X0T9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A087X0T9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A087X0T9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A087X0T9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A087X0T9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A087X0T9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A087X0T9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A087X0T9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A087X0T9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A087X0T9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A087X0T9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A087X0T9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A087X0T9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A087X0T9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A087X0T9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A087X0T9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A087X0T9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A087X0T9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A087X0T9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A087X0T9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A087X0T9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A087X0T9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms