Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 LCT-201ENST00000264162 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 EXD2-203ENST00000409018 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 C2orf71-201ENST00000331664 7044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPP3CB-202ENST00000360663 3501 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 UVSSA-202ENST00000389851 12605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 CFAP47-201ENST00000297866 3608 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 GDAP1-201ENST00000220822 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 CELF2-209ENST00000631460 5538 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABAT-202ENST00000396600 5586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 OGDHL-201ENST00000374103 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRAF1-203ENST00000546084 3715 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 MARF1-211ENST00000551742 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ASH1L-201ENST00000368346 11942 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTC39C-203ENST00000540918 4117 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 NLRP3-201ENST00000336119 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 RRP12-203ENST00000414986 4242 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD163L1-202ENST00000416109 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 FREM1-203ENST00000380894 2481 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 TNC-210ENST00000535648 7508 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC010886.1-201ENST00000437380 2869 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 GYG2-209ENST00000639373 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTPRA-202ENST00000318266 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 GCSAM-201ENST00000308910 3336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM13C-215ENST00000614220 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00964-202ENST00000510897 3534 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC139099.4-201ENST00000625083 3504 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 CXorf57-201ENST00000372544 3607 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRDM9-201ENST00000296682 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF568-202ENST00000415168 3774 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 COL12A1-201ENST00000322507 11723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM39A-201ENST00000319172 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 FGF5-201ENST00000312465 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRPM3-211ENST00000396280 4671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 NCAM1-228ENST00000621128 4698 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 COL12A1-207ENST00000483888 9637 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYOM1-203ENST00000400569 4927 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 SETD7-207ENST00000608958 5281 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 MARF1-202ENST00000540441 7105 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 GID8-201ENST00000266069 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF286B-201ENST00000285274 5145 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 THSD4-203ENST00000357769 3403 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZSCAN20-201ENST00000361328 4316 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADGRG6-203ENST00000367608 6879 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 CSMD2-203ENST00000373377 3212 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM171A1-201ENST00000378116 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRIG3-202ENST00000379141 3667 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM237-203ENST00000409883 5415 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SKP251-201ENST00000410830 314 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC064862.3-201ENST00000411435 571 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL136981.1-201ENST00000411450 549 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 PHTF2-205ENST00000416283 5198 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAMLD1-204ENST00000426613 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL683807.1-201ENST00000427886 445 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL354761.1-201ENST00000434190 526 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP001048.1-201ENST00000436359 280 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPSAP64-201ENST00000451820 336 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL355312.3-201ENST00000472053 312 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL685P-201ENST00000476271 298 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC112719.1-201ENST00000477971 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC104164.4-201ENST00000483456 493 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC034206.1-201ENST00000509372 474 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRIO-214ENST00000509967 4949 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ALG1L12P-201ENST00000515046 434 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC106774.1-201ENST00000515105 321 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP000757.1-202ENST00000525260 891 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms