Protein–RNA interactions for Protein: V9GYS6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYS6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GYS6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GYS6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GYS6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GYS6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GYS6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GYS6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GYS6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GYS6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GYS6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GYS6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GYS6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GYS6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GYS6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GYS6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GYS6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GYS6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GYS6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GYS6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GYS6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GYS6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GYS6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GYS6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GYS6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GYS6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GYS6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GYS6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GYS6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GYS6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYS6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
V9GYS6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
V9GYS6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
V9GYS6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
V9GYS6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
V9GYS6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
V9GYS6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
V9GYS6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
V9GYS6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
V9GYS6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
V9GYS6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
V9GYS6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
V9GYS6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
V9GYS6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
V9GYS6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
V9GYS6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
V9GYS6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
V9GYS6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms