Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNQ9UQP3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNQ9UQP3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms