Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH13Q9UKX3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYH13Q9UKX3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms