Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms