Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms