Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms