Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORCS2Q96PQ0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORCS2Q96PQ0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORCS2Q96PQ0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORCS2Q96PQ0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORCS2Q96PQ0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORCS2Q96PQ0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORCS2Q96PQ0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORCS2Q96PQ0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORCS2Q96PQ0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORCS2Q96PQ0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORCS2Q96PQ0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORCS2Q96PQ0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORCS2Q96PQ0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORCS2Q96PQ0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SORCS2Q96PQ0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORCS2Q96PQ0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORCS2Q96PQ0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORCS2Q96PQ0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORCS2Q96PQ0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORCS2Q96PQ0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SORCS2Q96PQ0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORCS2Q96PQ0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORCS2Q96PQ0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORCS2Q96PQ0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORCS2Q96PQ0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORCS2Q96PQ0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORCS2Q96PQ0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORCS2Q96PQ0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORCS2Q96PQ0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORCS2Q96PQ0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORCS2Q96PQ0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms