Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELP4Q96EB1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms