Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGNBP1Q5YKI7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GGNBP1Q5YKI7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GGNBP1Q5YKI7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GGNBP1Q5YKI7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GGNBP1Q5YKI7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GGNBP1Q5YKI7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GGNBP1Q5YKI7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GGNBP1Q5YKI7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms