Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 ARHGAP6-201ENST00000303025 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.583e-10■□□□□ 10
PUM1Q14671 ARHGAP6-205ENST00000380736 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.633e-10■□□□□ 10
PUM1Q14671 LASP1-204ENST00000435347 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.732e-7■□□□□ 10
PUM1Q14671 LASP1-203ENST00000433206 4023 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.742e-7■□□□□ 10
PUM1Q14671 LASP1-201ENST00000318008 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.832e-7■□□□□ 10
PUM1Q14671 PPP1R12A-206ENST00000547131 897 ntTSL 56.27□□□□□ -1.413e-10■□□□□ 10
PUM1Q14671 BRD4-209ENST00000601071 430 ntTSL 55.25□□□□□ -1.573e-10■□□□□ 10
PUM1Q14671 DRAP1-207ENST00000531121 672 ntTSL 320.96■□□□□ 0.958e-7■□□□□ 10
PUM1Q14671 HMG20B-203ENST00000416526 711 ntTSL 322.66■■□□□ 1.225e-8■□□□□ 10
PUM1Q14671 RANBP1-209ENST00000432879 744 ntTSL 313.95□□□□□ -0.183e-10■□□□□ 10
PUM1Q14671 MAP7D3-202ENST00000370660 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)15.33■□□□□ 0.044e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 QARS-212ENST00000470225 691 ntTSL 514.66□□□□□ -0.064e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.344e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 QARS-222ENST00000494838 959 ntTSL 312.82□□□□□ -0.364e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 QARS-242ENST00000635443 1053 ntTSL 512.43□□□□□ -0.424e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 QARS-205ENST00000430182 2399 ntTSL 212.04□□□□□ -0.484e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 QARS-251ENST00000637543 2074 ntTSL 511.69□□□□□ -0.544e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 QARS-202ENST00000414533 2412 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.544e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 QARS-248ENST00000636669 2410 ntTSL 511.36□□□□□ -0.594e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 QARS-247ENST00000636018 2171 ntTSL 510.25□□□□□ -0.774e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 QARS-209ENST00000464962 2362 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.784e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 QARS-201ENST00000306125 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.844e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 MAP7D3-203ENST00000370661 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.994e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 MAP7D3-204ENST00000370663 4446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.094e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 PACSIN2-210ENST00000453643 818 ntTSL 516.99■□□□□ 0.312e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 PACSIN2-208ENST00000445706 511 ntTSL 513.72□□□□□ -0.212e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 PACSIN2-206ENST00000418133 622 ntTSL 513.64□□□□□ -0.232e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 PACSIN2-207ENST00000422336 664 ntTSL 512.71□□□□□ -0.372e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 PACSIN2-209ENST00000453079 505 ntTSL 24.33□□□□□ -1.722e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.461e-7■□□□□ 10
PUM1Q14671 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.091e-7■□□□□ 10
PUM1Q14671 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.41e-7■□□□□ 10
PUM1Q14671 CLIC1-207ENST00000375780 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.481e-7■□□□□ 10
PUM1Q14671 CLIC1-210ENST00000616760 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.731e-7■□□□□ 10
PUM1Q14671 LARP1-211ENST00000521577 817 ntTSL 524.42■■□□□ 1.58e-10■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.61e-6■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91e-6■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.011e-6■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 KTN1-208ENST00000459737 4793 ntTSL 1 (best)2.4□□□□□ -2.031e-6■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.041e-6■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.11e-6■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.151e-6■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 02e-9■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.552e-9■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 UBXN4-201ENST00000272638 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.523e-12■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 UBXN4-208ENST00000490163 3394 ntTSL 23.52□□□□□ -1.853e-12■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 P4HB-208ENST00000473021 914 ntTSL 1 (best)15.11■□□□□ 0.012e-10■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 PSPC1-204ENST00000492741 1709 ntTSL 220.54■□□□□ 0.883e-6■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 PSPC1-203ENST00000471658 1647 ntTSL 1 (best)18.07■□□□□ 0.483e-6■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.463e-6■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.423e-6■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.215e-15■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.015e-15■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 LUC7L3-214ENST00000508482 1597 ntTSL 214.56□□□□□ -0.085e-15■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 LUC7L3-208ENST00000505658 7040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.865e-15■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 LUC7L3-205ENST00000504065 1071 ntTSL 56.44□□□□□ -1.385e-15■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 LUC7L3-219ENST00000511974 507 ntTSL 35.98□□□□□ -1.455e-15■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 LUC7L3-203ENST00000503728 783 ntTSL 55.85□□□□□ -1.475e-15■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 LUC7L3-216ENST00000509487 647 ntTSL 34.31□□□□□ -1.725e-15■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 LUC7L3-222ENST00000513969 419 ntTSL 33.18□□□□□ -1.95e-15■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 TACC3-203ENST00000458173 778 ntTSL 514.6□□□□□ -0.074e-13■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.343e-7■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 GPX4-208ENST00000592940 1184 ntTSL 522.74■■□□□ 1.233e-7■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.743e-7■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.743e-7■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.733e-7■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.543e-7■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 GPX4-203ENST00000585480 501 ntTSL 215.75■□□□□ 0.113e-7■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.033e-7■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 GPX4-204ENST00000587648 536 ntTSL 28.88□□□□□ -0.993e-7■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 PDAP1-202ENST00000426447 767 ntTSL 516.44■□□□□ 0.228e-11■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 SF3A3-206ENST00000487062 775 ntTSL 26.55□□□□□ -1.361e-11■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 UPF2-204ENST00000460569 640 ntTSL 29.76□□□□□ -0.852e-9■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 RPL6-212ENST00000553205 899 ntTSL 26.06□□□□□ -1.444e-9■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 MED15-226ENST00000478831 707 ntTSL 412□□□□□ -0.496e-8■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.262e-12■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 HIST1H3J-202ENST00000479986 522 ntTSL 222.86■■□□□ 1.252e-12■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 SUPT5H-212ENST00000598520 514 ntTSL 217.21■□□□□ 0.351e-11■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 EIF4A2-223ENST00000494445 629 ntTSL 29.98□□□□□ -0.811e-11■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 EIF4A2-225ENST00000496382 460 ntTSL 1 (best)6.17□□□□□ -1.421e-11■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 CERS2-202ENST00000345896 2170 ntTSL 227.95■■■□□ 2.062e-6■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.792e-6■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.552e-6■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 LDHA-209ENST00000478970 732 ntTSL 216.01■□□□□ 0.153e-25■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 CERS2-208ENST00000460664 850 ntTSL 315.39■□□□□ 0.052e-6■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 CERS2-204ENST00000368949 1002 ntTSL 513.66□□□□□ -0.222e-6■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 LDHA-213ENST00000535451 465 ntTSL 413.62□□□□□ -0.233e-25■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 CERS2-209ENST00000482825 1618 ntTSL 513.42□□□□□ -0.262e-6■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 CERS2-213ENST00000560793 1661 ntTSL 1 (best)12.5□□□□□ -0.412e-6■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 LDHA-205ENST00000422447 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.493e-25■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 CERS2-214ENST00000561294 1803 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.52e-6■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 LDHA-222ENST00000543695 554 ntTSL 510.81□□□□□ -0.683e-25■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 LDHA-208ENST00000469976 656 ntTSL 210.61□□□□□ -0.713e-25■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 LDHA-211ENST00000494573 1154 ntTSL 210.61□□□□□ -0.713e-25■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 LDHA-224ENST00000545467 570 ntTSL 28.77□□□□□ -1.013e-25■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 LDHA-223ENST00000545215 1340 ntTSL 1 (best)8.74□□□□□ -1.013e-25■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 LDHA-201ENST00000227157 1887 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.163e-25■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 LDHA-217ENST00000539814 556 ntTSL 47.52□□□□□ -1.213e-25■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 LDHA-214ENST00000536528 516 ntTSL 37.39□□□□□ -1.233e-25■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 LDHA-219ENST00000541097 582 ntTSL 37.1□□□□□ -1.273e-25■□□□□ 9.9
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