Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 SETD6-211ENST00000470003 593 ntTSL 216.73■□□□□ 0.272e-6■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 AL928654.4-202ENST00000547940 435 ntTSL 516.73■□□□□ 0.279e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 TXNRD2-220ENST00000634537 1086 ntTSL 516.69■□□□□ 0.269e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 EEF2K-204ENST00000568269 2367 ntTSL 1 (best)16.62■□□□□ 0.259e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 IPO4-204ENST00000558193 555 ntTSL 416.62■□□□□ 0.259e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 CERS5-210ENST00000547455 565 ntTSL 416.6■□□□□ 0.259e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 LYSMD4-211ENST00000604213 2356 ntTSL 1 (best)16.55■□□□□ 0.249e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.239e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 UBE3A-215ENST00000628267 779 ntTSL 516.5■□□□□ 0.234e-6■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 CERS5-204ENST00000438450 945 ntTSL 216.4■□□□□ 0.229e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 NEU4-206ENST00000415936 860 ntTSL 316.37■□□□□ 0.212e-12■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.219e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.29e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.21e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.29e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.199e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.199e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.184e-6■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDR1-270ENST00000513043 604 ntTSL 416.12■□□□□ 0.179e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDR1-243ENST00000482050 246 ntTSL 516.12■□□□□ 0.179e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 CERS5-211ENST00000547787 2132 ntTSL 216.1■□□□□ 0.179e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 TXNRD2-215ENST00000494454 2004 ntTSL 1 (best)16.07■□□□□ 0.169e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.169e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.159e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.159e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 HMGN2-205ENST00000466194 952 ntTSL 215.95■□□□□ 0.141e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.144e-6■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDR1-272ENST00000513243 549 ntTSL 515.88■□□□□ 0.139e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 CHTF18-206ENST00000461268 814 ntTSL 515.88■□□□□ 0.139e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 NEU4-208ENST00000423583 753 ntTSL 515.84■□□□□ 0.132e-12■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 EIF4A1-206ENST00000577929 696 ntTSL 215.81■□□□□ 0.122e-21■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 RIPOR1-218ENST00000566920 584 ntTSL 415.75■□□□□ 0.119e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 RIPOR1-210ENST00000565176 562 ntTSL 415.75■□□□□ 0.119e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ZNF318-202ENST00000605935 3836 ntTSL 1 (best)15.73■□□□□ 0.119e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MYO7A-207ENST00000481328 5740 ntTSL 215.72■□□□□ 0.119e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.119e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.099e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.099e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDR1-277ENST00000515219 481 ntTSL 515.53■□□□□ 0.089e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 EIF4A1-208ENST00000578476 573 ntTSL 215.5■□□□□ 0.072e-21■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.074e-6■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 TSPAN17-208ENST00000514705 4445 ntTSL 215.48■□□□□ 0.079e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 UBE2I-216ENST00000567383 538 ntTSL 415.48■□□□□ 0.072e-12■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.074e-6■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.069e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 TSPAN17-203ENST00000503030 909 ntTSL 315.43■□□□□ 0.069e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.069e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 TNIP1-212ENST00000521782 565 ntTSL 415.35■□□□□ 0.059e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.059e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 PIH1D1-223ENST00000602076 474 ntTSL 215.3■□□□□ 0.049e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 PIH1D1-224ENST00000602226 341 ntTSL 315.3■□□□□ 0.049e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ANKMY1-212ENST00000411765 652 ntTSL 415.23■□□□□ 0.039e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.029e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 C14orf80-213ENST00000455454 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.15■□□□□ 0.029e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.019e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 NCOR2-215ENST00000458234 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)15.11■□□□□ 0.019e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 GUK1-222ENST00000477206 589 ntTSL 215.11■□□□□ 0.012e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 LRCH4-205ENST00000485554 774 ntTSL 315.06■□□□□ 09e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -09e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 LRCH4-208ENST00000490359 540 ntTSL 214.99□□□□□ -0.019e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 CSNK1D-225ENST00000584913 295 ntTSL 214.98□□□□□ -0.012e-12■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.019e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MED26-202ENST00000597244 3871 nt14.96□□□□□ -0.019e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.029e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 THOP1-210ENST00000590533 616 ntTSL 214.95□□□□□ -0.028e-34■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDR1-261ENST00000507901 562 ntTSL 414.87□□□□□ -0.039e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.034e-6■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 CERS5-202ENST00000380189 2998 ntTSL 1 (best)14.86□□□□□ -0.039e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.039e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 INVS-207ENST00000496467 714 ntTSL 214.83□□□□□ -0.049e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 C14orf80-207ENST00000421892 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.77□□□□□ -0.059e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 GTF2F1-202ENST00000593678 1705 ntTSL 214.77□□□□□ -0.051e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.059e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 CERS5-217ENST00000549389 558 ntTSL 414.72□□□□□ -0.059e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.054e-6■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 TXNRD2-216ENST00000495655 2700 ntTSL 214.68□□□□□ -0.069e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.069e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 AL928654.4-205ENST00000550554 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.67□□□□□ -0.069e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 UBE2I-210ENST00000562482 735 ntTSL 214.63□□□□□ -0.072e-12■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDR1-263ENST00000508317 538 ntTSL 414.63□□□□□ -0.079e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDR1-257ENST00000505534 673 ntTSL 414.63□□□□□ -0.079e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.071e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ANXA6-212ENST00000521749 880 ntTSL 314.58□□□□□ -0.089e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDR1-235ENST00000428153 1257 ntTSL 514.56□□□□□ -0.089e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ST3GAL3-228ENST00000495482 887 ntTSL 214.55□□□□□ -0.089e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.089e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.089e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 NREP-220ENST00000513100 557 ntTSL 414.52□□□□□ -0.094e-6■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.099e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 NEU4-213ENST00000435934 451 ntTSL 414.51□□□□□ -0.092e-12■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.094e-6■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 TBRG4-204ENST00000461363 856 ntTSL 214.5□□□□□ -0.091e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 TSTA3-204ENST00000526290 488 ntTSL 314.48□□□□□ -0.092e-6■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.19e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ASL-208ENST00000488343 198 ntTSL 314.43□□□□□ -0.14e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDR1-248ENST00000503180 527 ntTSL 414.41□□□□□ -0.19e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MTFR1L-209ENST00000472643 838 ntTSL 314.41□□□□□ -0.11e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 CHMP4A-207ENST00000533523 1266 ntTSL 1 (best)14.4□□□□□ -0.19e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 PLD2-202ENST00000571273 736 ntTSL 214.37□□□□□ -0.111e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 RIPOR1-208ENST00000562755 538 ntTSL 414.37□□□□□ -0.119e-7■■■■□ 24.7
Retrieved 100 of 27,864 protein–RNA pairs in 274.8 ms