RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470003.5

SETD6-211, Transcript of SET domain containing 6, humanhuman

TSL 2

Gene SETD6, Length 593 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD6-211ENST00000470003 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.31■■■■■ 5.48
SETD6-211ENST00000470003 ABCC9O60706 1549 aa44.32■■■■■ 4.69
SETD6-211ENST00000470003 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.26■■■■■ 4.68
SETD6-211ENST00000470003 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.1■■■■■ 4.33
SETD6-211ENST00000470003 NACADO15069 1562 aa41.76■■■■■ 4.28
SETD6-211ENST00000470003 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.73■■■■■ 4.27
SETD6-211ENST00000470003 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.56■■■■■ 4.24
SETD6-211ENST00000470003 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.44■■■■■ 4.22
SETD6-211ENST00000470003 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.27■■■■■ 4.2
SETD6-211ENST00000470003 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.08■■■■■ 4.17
SETD6-211ENST00000470003 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.95■■■■■ 4.15
SETD6-211ENST00000470003 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
SETD6-211ENST00000470003 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.62■■■■■ 4.09
SETD6-211ENST00000470003 SCRIBQ14160 1630 aa40.46■■■■■ 4.07
SETD6-211ENST00000470003 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.13■■■■■ 4.02
SETD6-211ENST00000470003 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.04■■■■■ 4
SETD6-211ENST00000470003 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.9■■■■□ 3.98
SETD6-211ENST00000470003 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.84■■■■□ 3.97
SETD6-211ENST00000470003 SMARCA4P51532 1647 aa38.52■■■■□ 3.76
SETD6-211ENST00000470003 NCAPD3P42695 1498 aa38.52■■■■□ 3.76
SETD6-211ENST00000470003 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.47■■■■□ 3.75
SETD6-211ENST00000470003 SMARCA2P51531 1590 aa38.35■■■■□ 3.73
SETD6-211ENST00000470003 HMGXB3Q12766 1538 aa38.28■■■■□ 3.72
SETD6-211ENST00000470003 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.26■■■■□ 3.72
SETD6-211ENST00000470003 ERCC6Q03468 1493 aa38.2■■■■□ 3.71
SETD6-211ENST00000470003 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.12■■■■□ 3.69
SETD6-211ENST00000470003 NESP48681 1621 aa38.12■■■■□ 3.69
SETD6-211ENST00000470003 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.07■■■■□ 3.69
SETD6-211ENST00000470003 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.04■■■■□ 3.68
SETD6-211ENST00000470003 CUX2O14529 1486 aa38.03■■■■□ 3.68
SETD6-211ENST00000470003 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.01■■■■□ 3.68
SETD6-211ENST00000470003 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.72■■■■□ 3.63
SETD6-211ENST00000470003 WIZO95785 1651 aa37.72■■■■□ 3.63
SETD6-211ENST00000470003 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.71■■■■□ 3.63
SETD6-211ENST00000470003 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.68■■■■□ 3.62
SETD6-211ENST00000470003 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.44■■■■□ 3.58
SETD6-211ENST00000470003 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.38■■■■□ 3.57
SETD6-211ENST00000470003 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.21■■■■□ 3.55
SETD6-211ENST00000470003 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.17■■■■□ 3.54
SETD6-211ENST00000470003 WDR62O43379 1518 aa37.09■■■■□ 3.53
SETD6-211ENST00000470003 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
SETD6-211ENST00000470003 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.05■■■■□ 3.52
SETD6-211ENST00000470003 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.01■■■■□ 3.52
SETD6-211ENST00000470003 CFTRP13569 1480 aa36.96■■■■□ 3.51
SETD6-211ENST00000470003 PRDM2Q13029 1718 aa36.83■■■■□ 3.49
SETD6-211ENST00000470003 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
SETD6-211ENST00000470003 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.69■■■■□ 3.46
SETD6-211ENST00000470003 TRIM41Q8WV44 630 aa36.5■■■■□ 3.43
SETD6-211ENST00000470003 TOPBP1Q92547 1522 aa36.34■■■■□ 3.41
SETD6-211ENST00000470003 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
SETD6-211ENST00000470003 OSCARQ8IYS5 282 aa36.31■■■■□ 3.4
SETD6-211ENST00000470003 IFT140Q96RY7 1462 aa36.25■■■■□ 3.39
SETD6-211ENST00000470003 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.2■■■■□ 3.39
SETD6-211ENST00000470003 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
SETD6-211ENST00000470003 ABCC8Q09428 1581 aa36.13■■■■□ 3.37
SETD6-211ENST00000470003 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
SETD6-211ENST00000470003 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.01■■■■□ 3.35
SETD6-211ENST00000470003 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.01■■■■□ 3.35
SETD6-211ENST00000470003 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.01■■■■□ 3.35
SETD6-211ENST00000470003 CHD1O14646 1710 aa35.98■■■■□ 3.35
SETD6-211ENST00000470003 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.98■■■■□ 3.354e-9■■■■■ 51.3
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SETD6-211ENST00000470003 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.9■■■■□ 3.34
SETD6-211ENST00000470003 ARHGEF11O15085 1522 aa35.81■■■■□ 3.32
SETD6-211ENST00000470003 SOGA1O94964 1423 aa35.78■■■■□ 3.32
SETD6-211ENST00000470003 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.77■■■■□ 3.32
SETD6-211ENST00000470003 FBLN2P98095 1184 aa35.76■■■■□ 3.32
SETD6-211ENST00000470003 CUX1P39880 1505 aa35.76■■■■□ 3.31
SETD6-211ENST00000470003 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.31
SETD6-211ENST00000470003 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
SETD6-211ENST00000470003 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.6■■■■□ 3.29
SETD6-211ENST00000470003 WDR97A6NE52 1622 aa35.58■■■■□ 3.29
SETD6-211ENST00000470003 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.56■■■■□ 3.28
SETD6-211ENST00000470003 PBRM1Q86U86 1689 aa35.51■■■■□ 3.28
SETD6-211ENST00000470003 ARAP1Q96P48 1450 aa35.48■■■■□ 3.27
SETD6-211ENST00000470003 GRIN2BQ13224 1484 aa35.43■■■■□ 3.26
SETD6-211ENST00000470003 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
SETD6-211ENST00000470003 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
SETD6-211ENST00000470003 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.39■■■■□ 3.26
SETD6-211ENST00000470003 SYNJ1O43426 1573 aa35.36■■■■□ 3.25
SETD6-211ENST00000470003 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.35■■■■□ 3.25
SETD6-211ENST00000470003 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.32■■■■□ 3.25
SETD6-211ENST00000470003 SYNJ2O15056 1496 aa35.31■■■■□ 3.24
SETD6-211ENST00000470003 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.29■■■■□ 3.24
SETD6-211ENST00000470003 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.21■■■■□ 3.23
SETD6-211ENST00000470003 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
SETD6-211ENST00000470003 TOP2BQ02880 1626 aa35.17■■■■□ 3.22
SETD6-211ENST00000470003 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.12■■■■□ 3.21
SETD6-211ENST00000470003 ADAMTS12P58397 1594 aa35.05■■■■□ 3.2
SETD6-211ENST00000470003 GRIN2AQ12879 1464 aa35.01■■■■□ 3.19
SETD6-211ENST00000470003 CEP170Q5SW79 1584 aa34.97■■■■□ 3.19
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SETD6-211ENST00000470003 NUP160Q12769 1436 aa34.85■■■■□ 3.17
SETD6-211ENST00000470003 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.84■■■■□ 3.17
SETD6-211ENST00000470003 SHROOM2Q13796 1616 aa34.78■■■■□ 3.16
SETD6-211ENST00000470003 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
SETD6-211ENST00000470003 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.56■■■■□ 3.12
SETD6-211ENST00000470003 JPH4Q96JJ6 628 aa34.52■■■■□ 3.12
SETD6-211ENST00000470003 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.44■■■■□ 3.1
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