Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPOCK1Q08629 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPOCK1Q08629 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms