Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAE1P78406 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAE1P78406 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAE1P78406 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAE1P78406 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAE1P78406 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAE1P78406 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAE1P78406 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAE1P78406 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAE1P78406 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAE1P78406 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAE1P78406 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAE1P78406 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAE1P78406 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAE1P78406 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAE1P78406 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAE1P78406 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAE1P78406 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAE1P78406 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAE1P78406 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAE1P78406 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAE1P78406 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAE1P78406 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAE1P78406 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAE1P78406 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAE1P78406 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAE1P78406 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAE1P78406 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAE1P78406 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAE1P78406 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAE1P78406 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAE1P78406 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAE1P78406 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAE1P78406 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAE1P78406 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAE1P78406 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAE1P78406 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAE1P78406 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAE1P78406 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAE1P78406 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAE1P78406 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAE1P78406 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAE1P78406 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAE1P78406 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAE1P78406 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAE1P78406 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAE1P78406 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms